GSBrain是什么?

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生物信息分析体系庞大复杂,新方法新技术层出不穷,虽然有一些零散的网站或工具可以支持部分处理,但有时仍需了解一些令人头痛的命令行工具或编程知识,因此,GSBrain作为一款零门槛的生物信息可视化分析工具应运而生!

一、操作简单:GSBrain是一款基于模块化理念和通用性设计为原则的可视化多组学AI 分析平台,简单拖拽连接即可实现基因组等数据的分析挖掘和图表生成,无需编程,极简体验。

二、功能强大全面:GSBrains包含七大功能:全基因组关联分析(GWAS)、全基因组选择(GS)、基因同源度分析(HA)、拷贝数变异分析(CNV)、基因存在缺失变异分析(PAV)、启动子顺式调控元件(CRE)分析以及基于各类深度学习模型的多组学(基因、转录、蛋白、代谢和表型)的个性化预测分析。

1.全基因组选择(GS)

利用基因标记数据预测个体的遗传潜力,预测个体的基因组估计育种值(GEBV),加速育种进程。

2.全基因组关联分析(GWAS)

通过关联基因型与表型数据,识别与复杂性状相关的分子标记,寻找与特定性状相关的基因位点及变异。

3.同源度分析(HA)

比较不同物种或个体的基因或蛋白序列,分析基因之间的同源关系,揭示基因之间的进化关系和功能相似性。

4.拷贝数变异分析(CNV)

检测基因组中的拷贝数变化,评估其对性状、疾病或物种多样性中的作用。

5.基因存在缺失变异分析(PAV)

分析不同个体、品种或物种基因组中某些片段的缺失或存在,揭示其对性状和多样性的影响。

6.顺式元件分析(CRE)

研究基因表达调控区域的顺式元件,探索基因表达的时空特异性调控机制,揭示其在基因调控和响应环境刺激中的功能。

7.个性化分析

利用深度学习技术分析任意组学数据,支持基因组、转录组、蛋白组、代谢组和表型组。

三、扩展性强:GSBrain除了包含生信各类常规主流分析功能,还内置各类深度学习和经典机器学习模型以实现在基因组、转录组、蛋白组、代谢组和表型组的任意个性化建模分析,如基因组预测表型(GP)、转录丰度预测等。

四、应用范围广:可应用于分子育种、基因组数据训练分析、评估预测等领域,可以帮助研究人员在多个层面上进行深入的基因组分析。

  • 应用场景:分子育种、基因定位挖掘、复杂性状形成机制解析、基因编辑、种质资源精准鉴定、抗耐逆品种选育、通路分析、多组学结合深度学习的应用分析...
  • 适用作物:园艺作物、水稻、小麦、玉米、高粱、大豆、花生、草业、棉花、林木、中草药...

五、数据隐私安全:本地化部署,私有云平台,内置海量存储空间以轻松应对各组学TB级数据并可轻松扩容,开箱即用,无需维护。


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