鉴于上一篇NCBI 基因组数据下载有诸多bug，我重新改写了代码放在了 gitcode 上（其实是从自己的gitlab传过来的）。经测试，能有效批量下载数据。
详情见李鍶鐸 / NCBI Genome Data Download · GitCode
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参考：简书https://www.jianshu.com/p/9f96fc7438aa
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全基因组关联分析（GWAS）软件：gemma
版本：Version 0.94.1
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GEMMA 需要四个主要的输入文件，包括基因型、表型、相关矩阵和协变量（可选）。 基因型和表型文件可以是两种格式，都是 PLINK binary ped 格式或者都 BIMBAM 格式。不可混用。
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Nature Microbiology | 多组学识别疾病中共享和特异的宿主基因-菌群关联
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批量基因生存分析 简洁版本
input codes
load(file "G:/r/duqiang_IPF/GSE70866—true—_BAL_IPF_donors_RNA-seq/expr17077.RData")
head(expr.17077clean)
head(meta.17077)[,1:4]
dim(expr.17077clean)
dim(meta.17077)colnames(meta.17077)c(time,event,sex,diagnosis)phetransform(meta…