MEGA的使用

news/2024/11/23 5:17:08/

一.获得meg的文件
1.获得序列(没有的可以找我)
序列链接:链接:https://pan.baidu.com/s/1dhhn_W4ys-VEo5fxB1Z9ow
提取码:1234
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2.直接拉到mega的软件图标上,打开
3.然后align
在这里插入图片描述
4.根据自己的需要选择参数,这里我选择默认在这里插入图片描述
5.比对(可能会花很长时间)
在这里插入图片描述
6.保存为meg文件
在这里插入图片描述
在data里第七项,export alignment ,选择第一种文件格式。

二.建立矩阵
1.在mega主页面,file打开你的meg文件在这里插入图片描述
2.会出现
在这里插入图片描述
3.选择建立矩阵按钮,然后选第一项
在这里插入图片描述
4.设置合适的参数(自行选择)
在这里插入图片描述
5.得到矩阵,可以导出,也可以直接截图。
在这里插入图片描述
三.建立进化树
1.和建立矩阵一样,点击下图的按钮,然后选第一项在这里插入图片描述
2.选择合适的参数
在这里插入图片描述
3.运行,下图到100就可以stop,如果愿意等也可以
在这里插入图片描述
4.在画树完成以后,我们可以看到两个图,第一个叫做Original Tree 还有一 个是Bootstrap consensus tree。
5.修改内容,添加标注
这里所有的修改都在view->Tree options中。
6.导出
在Image中中我们可以导出PDF或者PNG格式的图片。

在这里插入图片描述
四。S蛋白和M蛋白也一样


http://www.ppmy.cn/news/404182.html

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