运动神经元疾病提倡以中医中药为主的治疗方法。本病以虚证多见，或虚实夹杂，一般的治疗原则为补脾益损，温养肾阳，滋补肝血，养阴祛湿，其方法有以下几种。
辨证分型治疗
按照中医传统的辨证论治方法，本病可以分为以下证型。　　
1．脾胃虚损
主证：肌肉萎缩，肢体萎软无力，或有肌肉颤动，少气懒言，语音低弱，咀嚼无力，吞咽不顺利，口张流涎，食少，便溏，腹胀，面色淡白无华。舌体胖嫩淡，苔薄白或白腻，脉细。
治法：补脾益损，强肌健力。
2．脾肾虚损
主证：肌肉萎缩。肢体萎软无力，肌肉时有颤动，腰酸颈垂，畏寒肢冷，呼吸气短，精神疲惫。语音含糊，吞咽困难，咳嗽无力，小便清长，性功能低下或月经失调。舌嫩淡胖，苔薄白，脉沉细。
治法：补益脾肾，强肌健力。　
3．肝肾阴虚
主证：肌束震颤，肌萎肉削，大肉瘦脱，形体消瘦。筋骨拘挛，动作益衰，甚至步履全废。大便秘结。舌红，舌体萎软、薄瘦。苔少，脉细数。
治法：滋补肝肾。　
4．湿热浸淫，虚实夹杂
主证：四肢萎软乏力，身体困倦沉重，肌肉跳动，肢体麻木，身热口干，胸痞院闷，小便短赤涩痛。舌红，苔黄腻，脉弦数。
治法：清热利湿，补虚泻实。　
运动神经元病饮食疗法
在治疗运动神经元损害和肌源损害，以及重病肌无力、肌肉萎缩、进行性肌营养不良等症的同时，无论病人的病情是脾虚所弱型、脾肾阴虚型、脾肾阳虚型、肝血不足型、气血两亏型、心血不足型、肺虚痰湿型等哪种类型，都是少食寒凉，多食温补。
例如：芥菜、绿豆、海带、紫菜、西泮菜、白菜、黄花菜、西瓜、苦瓜、冬瓜等都属寒凉食品，病人尽量避免服食。
一般患者宜多食甘温补益食品，如：小米、大枣、山楂、山药、当归、赤小豆、莲子、葡萄干、核桃仁、生姜、牛肉、羊肉、乌鸡等，还可以买瓶纯天然蜂王浆，最有利于增强自身免疫力，有帮助病情恢功效。甘味食物能够起到补益、和中、缓急的作用，因此来说滋补强壮，调节人体五脏、气、血、阴、阳，任何一亏虚症
预防常识：
本病迄今病因未明有学者认为是慢性病毒感染引起，起病后病情呈缓慢进行性加重但可用神经生长因子或细胞生长肽肌注治疗，目前尚无特效的措施能阻止病情的进展，患者往往在后期出现并发症。但若能精心护理，加强对症支持综合治疗，就能较大限度缓解症状、延长生命。劝告患者及其亲属，因本病诊治专科性较强，发病后应到有条件的神经疾病专科诊治，切勿轻信社会游医，以免误诊误治，浪费钱财。