目录
- 相关概念
- 1. 转录本
- 2. 什么是L1000技术
相关概念
1. 转录本
转录本(transcript)是指在基因表达中产生的RNA分子。基因是DNA上的一段特定序列,通过基因表达,该DNA序列的信息被转录为RNA。转录本是这个转录过程的产物,是RNA的一种形式。
有两种主要类型的转录本:
-
mRNA(信使RNA): mRNA是最常见的转录本类型,它包含了编码蛋白质的信息。在真核生物中,mRNA由转录过程产生,并带有一系列的外显子和内含子。经过剪接过程,内含子被剪切出去,而外显子被保留,形成成熟的mRNA分子。mRNA离开细胞核,进入细胞质,被翻译为蛋白质。
-
非编码RNA(ncRNA): 与mRNA不同,非编码RNA并不编码蛋白质,而在细胞中担任其他功能。这包括多种类型,如:
rRNA(核糖体RNA): 参与构建细胞核糖体的RNA。
tRNA(转运RNA): 在蛋白质合成中传递氨基酸到正在合成的蛋白质链上。
miRNA(微小RNA): 调控基因表达的小RNA分子。
lncRNA(长链非编码RNA): 具有多种功能,包括调控基因表达和细胞过程。
总体而言,转录本是基因表达的产物,代表了特定基因的RNA副本,可以用于传递遗传信息(mRNA)或执行多种细胞功能(非编码RNA)。
2. 什么是L1000技术
L1000 技术是整合网络细胞印记库项目(Library of Integrated Network Based Cellular Signatures, LINCS)中使用的低成本基因表达谱测定技术。其考虑基因表达之间的相关性,将需要测量的基因目大幅减小,从而达到控制成本的目的.L1000 技术是挑选 978 个标志基因进行测量,进一步通过构建模型外推出其他基因的表达量。实验数据表明这些标志基因的表达可以代表全基因组 80%的信息。虽然存在一定误差,但是该技术可以将成本缩减到全基因组基因芯片成本的 1%,使得测量大规模基因表达谱得以实现.