CryoEM - 冷冻电镜 CryoSPARC 单颗粒图像数据集构建

news/2024/11/14 16:02:54/

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CS
CryoSPARC 的 downsample 操作是一种用于减少数据集大小的技术,可以提高计算效率和内存使用率。downsample 操作的原理是将原始图像的分辨率降低,从而减少每个图像的像素数。这样做的好处是可以加快图像处理的速度,减少噪声的影响,以及节省存储空间。downsample 操作可以在 CryoSPARC 的预处理模块中进行,用户可以根据需要设置目标分辨率或缩放因子。

目标:构建 EMPIAR 10028 的 100000 个单颗粒图像的数据集。

下载 EMPIAR 10028 数据集,参考:CryoEM - 冷冻电镜 EMPIAR 数据集的下载过程,整体数据集较大,目前使用100000个图像,使用 CryoSPARC 软件,进行降采样 (downsample)。

1. 导入颗粒图像

创建项目(Project) - 工作空间 (Workspace),在 Job Builder


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