Ubuntu: 自留小技巧

server/2024/10/18 18:23:37/
#!/bin/bash# 指定要检查的文件夹
folder="/path/to/your/directory"# 遍历文件夹中的每一个文件
for file in "$folder"/*
do# 检查文件中的每一行是否都包含"#"if awk '!/#/' "$file" | read -r _then# 如果有一行不包含"#",则跳过这个文件continueelse# 如果所有行都包含"#",则删除这个文件rm "$file"fi
done

 如果所有行都包含"#",则删除这个文件

ubuntu小技巧自己留(不定时更新)-CSDN博客

输出fasta文件>序列名字到一个txt文件

grep ">" fasta_file > output_file

将fasta序列名第一个空格之后的内容去掉

>AB000403.1_1 # 104 # 679 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.405

>AB000403.1_1

awk '{print $1}' your_fasta_file.fasta > new_fasta_file.fasta

http://www.ppmy.cn/server/19223.html

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