慢更ing，主要是记录自己在分析中的一些困惑

一、基础知识和解惑

放在最前面，是因为scvi整合不像harmony，傻瓜式操作，很多地方还是要注意一下的。

1.如何正确的寻找HVGs

一般我们使用的函数就是scanpy.pp.highly_variable_genes，里面的参数较为复杂。

Expects logarithmized data, except when flavor='seurat_v3'/'seurat_v3_paper', in which count data is expected.

参考资料1

2.Latent的概念

Q：Latent参数在哪里设置？运行后又储存在哪里？

A：首次出现应该在模型训练前

python">model = scvi.model.SCVI(adata,n_latent&