MySQL服务启动时，可以指定用于存储进程ID文件的位置。这通常通过在启动服务时使用--pid-file选项来完成。如果你想要改变默认的PID文件位置，可以在my.cnf（在Unix系统上通常位于/etc/my.cnf或/etc/mysql/my.cnf）或my.ini（在Windows系统上）中设置。

例如，在my.cnf中，你可以添加以下行来指定PID文件的位置：

[mysqld]
pid-file = /path/to/your/custom/mysql.pid

如果你想要在启动命令中临时指定PID文件的位置，可以这样做：

mysqld --pid-file=/path/to/your/custom/mysql.pid

请确保指定的路径是可写的，并且MySQL进程有权限在该位置创建文件。如果指定的位置已经有一个PID文件存在，MySQL将不会覆盖它，除非它属于同一个MySQL服务实例。