定量医学影像临床研究与实践
任务
定量成像教程
定量成像是从医学影像中提取定量测量的过程。
本教程基于两个定量成像的例子构建：
- 形态学：缓慢生长肿瘤中的小体积变化
- 功能：鳞状细胞癌中的代谢活动
第1部分：使用变化跟踪模块测量脑膜瘤的小体积变化
第2部分：使用PET标准摄取值计算模块测量鳞状细胞癌的代谢活动
课程数据位于目录：/QuantitativeImaging
- dataset1_MR_Head（头部MR数据集）
- dataset2_ChangeTracker（变化跟踪数据集）
- dataset3_PETCT（PET-CT数据集）
每个数据集都采用Slicer的.mrb文件格式。
数据集已经下载并解压缩，如下图
Slicer mrb文件格式
- Slicer的mrb文件是一个存档文件，包含了加载到Slicer4的所有数据。
- .mrb文件实际上是一个.zip文件，但是使用了不同的文件扩展名。
slicer介绍
- 一个跨学科平台
- 为软件开发者提供的开源环境
- 为临床研究者和科学家提供的最终用户应用程序
- 一个既易于临床研究人员使用，又易于程序员扩展的软件平台
3D Slicer 历史
- 1997年：Slicer作为外科规划实验室（哈佛）和计算机科学与人工智能实验室（麻省理工学院）之间的一个研究项目开始。（图片由麻省理工学院计算机科学与人工智能实验室提供。
- 2015年：多机构共同努力，与临床医生和科学家分享最新的图像分析进展。（可扩展平台。强大的处理能力。简化的界面。）
多机构：NA-MIC， NAC， NCIGT
肿瘤体积变化测量-缓慢生长肿瘤的小体积变化
- 通常使用CT或MRI进行的传统解剖成像用于评估肿瘤的大小和形状。
- 大多数评估新化疗药物的临床试验使用一维或二维测量的变化来评估反应（例如，RECIST）。
- Slicer拥有多种工具，用于应用RECIST方法。
传统肿瘤反应的测量方法：3D Slicer Markups模块可以用来测量肿瘤横截面的直径，并提供交互式的数字注释。
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