b0像是什么,b0像的去脑壳后的mask如何得到?
b0像是DTI图像在扫面生成时b=0是对应的图像,大家在拿到每个人的DTI数据时每个被试都有三个文件,bval文件,bvec文件和一个原始图像文件。这个图像文件可以用fslview打开,bval文件中存放的b在每次扫描的值,bvec存放的是每次扫描的方向值。
而那个原始图像文件是一个4D的图像,第4维是扫描的不同的梯度方向。我的数据扫描了60方向,所以每个人的原始数据有60个图像。这个原始图像中的每个图像和bval文件及bvec文件的值是一一对应的,因此要找到b=0的图像就是找bval中0那个值所对应的图像。
知道b0图像是啥后就是如何提取这个图并产生去脑壳后的mask了
我用fslroi以及bet 这指令,同样你在控制台上输入fslroi或者bet会出现一大堆信息。这里我用的参数是 fslroi 校正过后的数据 提取出的b0图像 0 1
bet 提取出的b0图像 所要的去脑壳的mask -m -v -o -g 0.2 -f 0.3 参数视具体情况而定。