这个问题我查看了许多资料，最后总结一下：
我首先看了IOS端微信关于下载app的整个逻辑：
关于公众号里面关于微官网里面的app下载，如果你将你的应用中在微信开发平台认证过来，这个是要掏钱的；你点微官网app的下载，是可以直接跳到APP Store里面，检测这个应用是否已经下载，如果下载，直接打开；
而对于android 端，相比较IOS，就有更多方法，实现这个可能了。
1：微信开发平台认证，我要下载的链接，放在认证里面（不过不是单独的下载链接，你必须上传你的app到应用商城里面的下载地址）；费钱的，就不要考虑了；
2：第二种方案：点击app下载之后，给你一个操作的图层，在手机自己的浏览器打开，这个操作多了一步，我感觉会影响用户体验的。对于这个用户体验我，我会稍后详解；（这个链接里面的这个效果）http://ju.outofmemory.cn/entry/117648
3：我自己的app在应用宝里面发布，之后就可以把这个下载的app链接，放在你的微官网里面，当你点击下载的时候，他会直接在你微信里面打开。这个界面就是应用宝的界面点击下载（可以检测你的手机是否安装这个应用，安装的话，直接跳到app）；
另外，在应用宝里面。你也可以申请微下载，和上面的第三部类似，但是我看到一个哥们。对这个微下载，做个一个很牛逼的处理。http://m.zhihu.com/question/23925409，但测试的结果，就不是特别好了，这个哥们，直接我二维码里面的url提取，出来，在微信里面可以直接下载，但是无法检测你的手机是否装载了这个应用，这点感觉不是很好，
另外，微信里面对于有没有可以在微官网里面，可以把你的例如一个订房的数据传到你所在的app里面。就是参数传递，，有待进一步研究中；