今天我们继续来聊一聊ImageJ的高阶使用技巧。
问题三、为什么总是全部圈起来的灰度值,有没有大神指导呢求助!
本问题涉及免疫印迹(Western Blot)分析,提问者不能分别得到每个条带的值。
灰度值0为纯黑,255为纯白,灰度值与光密度值(OD值)的关系如下图所示:
以灰度来统计WB条带的话,无条带的纯白255左右,条带越黑着色越深灰度值反而越小,这与我们的认知不符。
步骤:
1. File -> Open -> 打开需要分析的WB条带。
2. Image –> Type -> 8-bit, 将图像转换为8-bit的灰度图片;Image-> Invert,黑白反转,得到如下图片:
3. Analyze -> Calibrate, 校正光密度值Function中选择Uncalibrated OD,左下方Global calibration,勾选表示有多张图片打开时对所有图片进行此操作。否则只对当前图片进行此操作。
4. 在工具栏中选择矩形工具——Rectangular, 最左边的为矩形工具,选择条带: