AmberTools23的安装

news/2024/11/20 11:29:11/

关于ambertools的安装方法,以往卢天老师或是其他安装教程都是按照 下载源码——编译 的流程来安装的,现在官方出了一个新教程,直接利用conda 直接下载安装,方法非常简单,看网上没有相关的说明,特此翻译一个来,适用于Linux或Macos,以Linux为例:

1、安装miniconda 在 Miniconda — conda documentation 中挑选你的系统并下载安装包(Linux是 *.sh)

2、利用终端对*.sh文件进行可执行授权 (在文件目录下执行 chmod +x ./*.sh,星号换成文件名)

3、然后按照英文提示进行安装,(记不太清了)

        a. 按Enter 确认安装  

        b. 按空格至协议底部并输入yes同意协议

        c. 确认安装路径,或者按需修改

        d. 安装完毕

        e. 配置环境 即 在 用户根目录下 修改 .bashrc文件,添加 export        PATH=/home/user/miniconda/bin:$PATH  其中 User换成用户名,并最好核实一下安装路径

        f. 最后 应用环境配置 终端输入 source ./.bashrc

4、创建环境 激活环境 安装ambertools包 

          conda create --name AmberTools23
          conda activate AmberTools23

          conda install -c conda-forge ambertools=23

5、安装跑完就可以了,平时要用的话,首先要 激活环境 conda activate AmberTools23 然后就可以开始命令计算了


http://www.ppmy.cn/news/404442.html

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