文章目录
- R语言介绍
- R语言基本语法
- R语言常用函数有哪些
- R语言数据结构
- 向量
- 矩阵
- 数组和列表
- 数组
- 列表
- 数据框
- 因子
- R如何导入数据
- 如何在R语言中导出数据?
- R语言图形绘制
- 描述性统计
- 描述统计也可以这样来计算
- 统计推断
- 配对设计t检验
- 样本均数和总体均数t检验
- 两(独立)样本t检验
- R语言组间差异的非参数检验
- 单因素方差分析
- R语言双因素方差分析方法
- R语言重复测量方差分析
- 回归分析
- R语言回归分析
- R语言多元回归分析
- R语言logistic回归分析
- R语言主成分和因子分析
- R语言聚类分析方法
- 数据分析中缺失值的处理方法
我与Bing chatGPT关于R语言的会话
Bing chatGPT对每个问题给出的答案都很简洁,但是给出了进一步的参考链接。不妨深入研究具体的内容,获得更详细的内容。
R语言介绍
1 R语言 - 维基百科,自由的百科全书
2 R 语言教程 | 菜鸟教程
3 R语言安装教程
4 R: The R Project for Statistical Computing
5 R: What is R? - r-project.org
你好,这是必应。我可以帮你介绍一下R语言。R语言是一种用于统计分析、绘图和数据挖掘的编程语言和操作环境1 2。它是一个自由、免费、开源的软件,可以在多种平台上运行3 4。R语言是基于S语言的,S语言是一种在贝尔实验室开发的统计计算语言4。R语言有很多用户编写的扩展包,可以提供更多的功能和应用1。
如果你是一个数学研究工作者,或者对统计分析、绘图和数据挖掘感兴趣,R语言可能是一个很好的选择。但是,如果你是一个计算机程序的初学者,或者想了解通用编程,R语言可能不是一个理想的选择,你可以考虑Python、C或Java等其他语言2。R语言是一种解释型的语言,它的执行速度比编译型的语言慢得多,不利于优化2。
要使用R语言,你需要先安装R软件3 4,然后可以使用R自带的控制台或者其他集成开发环境(IDE)来编写和运行R代码5。你也可以从CRAN(Comprehensive R Archive Network)或者其他网站下载和安装R扩展包3 4,来增加R的功能和应用。
我希望这些信息对你有用。😊
R语言基本语法
R语言的基本语法包括以下几个方面:
- 赋值操作:R语言使用符号“<-”或“=”来给变量赋值,例如 x <- 10 或 y = “Hello”。
- 注释:R语言使用符号“#”来表示注释,注释是对代码的说明,不会被执行,例如 # 这是一个注释。
- 输出:R语言使用函数 print() 来输出值或表达式,例如 print(“R语言”) 或 print(2+3)。
- 数据类型:R语言支持多种数据类型,如数值、字符、逻辑、复数、因子、向量、矩阵、数组、列表和数据框等。
- 数据结构:R语言的数据结构是指数据的组织形式,如向量是一维的数据结构,矩阵是二维的数据结构,数组是多维的数据结构,列表和数据框是混合类型的数据结构等。
- 运算符:R语言有多种运算符,如算术运算符(+ - / ^ %% %/%)、关系运算符(< > == != <= >=)、逻辑运算符(! & | xor)、赋值运算符(<- = -> ->> <<-)和特殊运算符(: %in% %%)等。
- 控制流程:R语言有多种控制流程语句,如条件语句(if else ifelse switch)、循环语句(for while repeat break next)、函数定义(function)和异常处理(try catch finally)等。
你可以参考以下网站来学习更多关于R语言基本语法的内容:
- 1 R语言基础语法 - 简书
- 2 R 基础语法 | 菜鸟教程
- 3 R语言实战之R语言基础语法精讲(一) - 知乎
R语言常用函数有哪些
R语言有很多常用的函数,根据功能不同,可以分为以下几类:
- 数学函数:如 abs() 求绝对值, sqrt() 求平方根, log() 求对数, sin() 求正弦, cos() 求余弦等。
- 统计函数:如 mean() 求均值, sd() 求标准差, var() 求方差, median() 求中位数, max() 求最大值, min() 求最小值等。
- 概率函数:如 dnorm() 求正态分布的密度函数, pnorm() 求正态分布的分布函数, qnorm() 求正态分布的分位数函数, rnorm() 生成正态分布的随机数等。一般来说,概率函数的命名规则是 [x][function],其中 x 表示指定的分布,如 norm 表示正态分布, function 表示函数类型,如 d 表示密度函数, p 表示分布函数, q 表示分位数函数, r 表示随机数函数等。
- 字符处理函数:如 paste() 连接字符串, substr() 提取子字符串, nchar() 计算字符串长度, toupper() 转换为大写字母, tolower() 转换为小写字母等。
- 其他函数:如 length() 计算对象长度, dim() 获取对象维度, class() 获取对象类型, summary() 获取对象摘要信息, help() 获取帮助文档等。
你可以参考以下网站来学习更多关于R语言常用函数的内容:
1 R语言常用函数总结大全_r语言函数大全及详解_王亨的博客-CSDN博客
2 R语言常用函数汇总 - 知乎
3 R语言常用函数整理(基础篇) - 简书
R语言数据结构
R语言中的数据结构是用于保存多个值的工具。 R的基础数据结构通常按其维度(1D、2D或nD)以及它们是同质的(所有元素必须是相同的类型)还是异质的(元素通常有各种类型)来组织。 常见的数据结构包括向量、矩阵、数组、列表、数据框和因子等12。
向量是由相同基本类型元素组成的序列,相当于一维数组。矩阵是由相同类型的元素组成的二维数组12。
向量
在R中,可以使用c()函数来创建向量。例如,要创建一个由1、2、3组成的向量,可以使用以下代码:
vector1 <- c(1, 2, 3)
在R中,可以使用方括号[]来访问向量中的元素。例如,要访问向量vector1中的第2个元素,可以使用以下代码:
vector1[2]
矩阵
在R中,可以使用matrix()函数来创建矩阵。例如,要创建一个由1、2、3和4、5、6组成的2x3矩阵,可以使用以下代码:
matrix1 <- matrix(c(1, 2, 3, 4, 5, 6), nrow = 2)
在R中,可以使用方括号[]来访问矩阵中的元素。例如,要访问矩阵matrix1中的第1行第2列的元素,可以使用以下代码:
matrix1[1, 2]
数组和列表
在R中,数组和列表都是一种数据结构,但它们有不同的特点。数组是一种多维数据结构,其中所有元素必须是相同的数据类型。列表是一种可以包含不同数据类型元素的一维或多维数据结构12。
数组
在R中,可以使用array()函数来创建数组。例如,要创建一个由1、2、3和4、5、6组成的2x3x1数组,可以使用以下代码:
array1 <- array(c(1, 2, 3, 4, 5, 6), dim = c(2, 3, 1))
在R中,可以使用方括号[]来访问数组中的元素。例如,要访问数组array1中的第1行第2列的元素,可以使用以下代码:
array1[1, 2, 1]
列表
在R中,可以使用list()函数来创建列表。例如,要创建一个包含向量vector1和矩阵matrix1的列表,可以使用以下代码:
list1 <- list(vector1, matrix1)
在R中,可以使用方括号[]或双方括号[[]]来访问列表中的元素。例如,要访问列表list1中的第1个元素,可以使用以下代码:
list1[[1]]
数据框
在R语言中,数据框是一种基础数据格式,类似于Excel中的表格形式数据。数据框是一种二维的表格结构,每一列可以包含不同模式(数值型、字符型等)的数据,每一列都有一个唯一的列名,长度都是相等的。你可以使用data.frame()函数来创建数据框。例如,下面的代码创建了一个包含site、season和pH三列的数据框:
df <- data.frame(site = c("A", "B", "C"), season = c("spring", "summer", "fall"), pH = c(7.2, 6.8, 7.1))
你可以使用方括号[]或双方括号[[]]来访问数据框中的元素。例如,要访问数据框df中的第1行第2列的元素,可以使用以下代码:
df[1, 2]
因子
在R语言中,因子(factor)是一种特殊的数据类型,用于存储不同类别的数据,可以用来对数据进行分组。例如,人的性别有男和女两个类别,根据年龄可以将人分为未成年人和成年人,考试成绩可以分为优、良、中、差等。你可以使用factor()函数来创建因子。例如,下面的代码创建了一个包含性别和年龄两列的因子:
sex <- factor(c(“男”, “女”, “男”, “女”), levels = c(“男”, “女”))
age <- factor(c(“<18”, “>=18”, “<18”, “>=18”), levels = c(“<18”, “>=18”))
你可以使用方括号[]或双方括号[[]]来访问因子中的元素。例如,要访问因子sex中的第1个元素,可以使用以下代码:
sex1
R如何导入数据
R语言中有多种方法可以导入数据,其中最常用的方法是使用read.table()函数。read.table()函数可以从带分隔符的文本文件中导入数据,并将其保存为一个数据框。例如,要从名为data.csv的文件中导入数据,可以使用以下代码:
mydataframe <- read.table(“data.csv”, header = TRUE, sep = “,”)
其中,header = TRUE表示第一行包含列名,sep = ","表示使用逗号作为分隔符。你还可以使用read.csv()函数来读取.csv文件,该函数是read.table()函数的一个特例。例如,要从名为data.csv的文件中导入数据,可以使用以下代码:
mydataframe <- read.csv(“data.csv”)
如何在R语言中导出数据?
R语言中有多种方法可以导出数据,其中最常用的方法是使用write.table()函数。write.table()函数可以将数据框中的数据写入到文本文件中。例如,要将名为data.csv的文件导出为逗号分隔的文本文件,可以使用以下代码:
write.table(mydataframe, file = “data.csv”, sep = “,”, row.names = FALSE)
其中,file = "data.csv"表示将数据写入到名为data.csv的文件中,sep = ","表示使用逗号作为分隔符,row.names = FALSE表示不包含行名。你还可以使用write.csv()函数来将数据框导出为.csv文件,该函数是write.table()函数的一个特例。例如,要将名为data.csv的文件导出为.csv文件,可以使用以下代码:
write.csv(mydataframe, file = “data.csv”, row.names = FALSE)
R语言图形绘制
R语言提供了许多绘图函数,包括plot()、hist()、boxplot()、barplot()、pie()等等。这些函数可以用于绘制各种类型的图形,如散点图、直方图、箱形图、条形图和饼图等等。你可以根据需要选择适当的函数来绘制你想要的图形。
例如,要绘制一个简单的散点图,可以使用以下代码:
x <- c(1, 2, 3, 4, 5)
y <- c(2, 4, 6, 8, 10)
plot(x, y)
plot()函数是R语言中最基本的绘图函数之一,主要用于绘制散点图和折线图。它有许多参数,包括x、y、type、xlim、ylim、log、main、sub、xlab、ylab等等。其中,x和y是必需的参数,它们分别指定了横坐标和纵坐标的数据。type参数控制要绘制的图的类型,例如,要创建在数据点之间带有线的图,请使用type =“ l”;要仅绘制点,请使用type =“ p”;并绘制线条和点,请使用type =“ b”:1
这将绘制一个由5个点组成的散点图,其中x轴表示x向量中的值,y轴表示y向量中的值。
在R语言中,图形绘制参数包括符号、线条、颜色、文本参数、图形尺寸及边界等。你可以使用par()函数来设置这些参数。例如,要设置符号的大小和颜色,可以使用以下代码:
par(pch = 19, col = “red”)
这将设置符号的大小为19,颜色为红色。你还可以使用其他参数来设置线条的类型、颜色和宽度,文本的字体、大小和颜色,图形的尺寸和边界等等。
描述性统计
这一章介绍了基本的统计方法,包括描述性统计、频率和列联表、相关和协方差、t检验和非参数统计。你将学习如何用R导入数据,并用各种函数对数据进行组织和转换,使之成为有用的格式。然后我们回顾了可视化数据的基本方法。 你的数据组织好后,你通常需要先用数字描述每个变量的分布,然后探索选定变量之间两两的关系。目标是回答这样的问题:
- 现在汽车的油耗是怎样的?具体来说,在对汽车品牌和型号进行调查时,每加仑英里数(平均值、标准差、中位数、范围等)的分布是怎样的?
- 在一次新药试验后,药物组和安慰剂组的结果(无改善、有些改善、明显改善)是什么?
- 参与者的性别是否对结果有影响? 收入和预期寿命之间有什么相关性?它是否显著不同于零?
- 在美国不同地区犯罪是否更可能受到监禁?地区之间的差异是否具有统计学意义?
用R进行基本描述性和推断性统计的函数。首先,我们将看看定量变量的位置和尺度的度量。然后,你将学习如何生成分类变量的频率和列联表(以及相关的卡方检验)。接下来,我们将研究连续和有序变量可用的各种形式的相关系数。最后,我们将通过参数(t检验)和非参数(曼-惠特尼U检验,克鲁斯卡尔-沃利斯检验)方法研究组间差异。虽然我们的重点是数字结果,但我们将在整个过程中提到可视化这些结果的图形方法。 本章涵盖的统计方法通常在大学一年级的统计课程中教授。如果这些方法对你来说不熟悉,两本优秀的参考书是McCall (2000) 和 Kirk (2008)。或者,每个主题都有许多有用的在线资源(如维基百科)。 7.1 描述性统计 在本节中,我们将看看连续变量的中心趋势、变异性和分布形状的度量。为了说明目的,我们将使用第一章中你见过的汽车趋势杂志汽车路测(mtcars)数据集中的几个变量。我们关注每加仑英里数(mpg)、马力(hp)和重量(wt):
myvars <- c('mpg','hp','wt')
head(mtcars[myvars])
首先,我们将看看所有32辆车的描述性统计。然后, 我们将按传动类型查看描述性统计
R语言中计算描述性统计的方法。它介绍了mtcars数据集中的几个变量,如变速箱类型(am)和发动机缸配置(vs)。它还展示了如何使用summary()函数和sapply()函数来获取最小值、最大值、四分位数、均值等统计量。这些函数可以用于数值变量和因子变量。
myvars <- c("mpg", "hp", "wt")
summary(mtcars[myvars])
关于R语言中的apply()函数和sapply()函数的用法。apply()函数可以对数组、矩阵或数据框的某一维度(行或列)应用一个函数,返回一个向量、数组或列表。sapply()函数可以对数据框的每一列应用一个函数,返回一个向量或矩阵。这些函数可以使用R中内置的或自定义的任意函数,例如mean(), sd(), var(), min(), max(), median(), length(), range(), quantile()等。fivenum()函数可以返回Tukey的五数概括(最小值、下四分位数、中位数、上四分位数和最大值)。123
sapply(x, FUN, options)
mystats <- function(x, na.omit=FALSE){ if (na.omit) x <- x[!is.na(x)] m <- mean(x) n <- length(x) s <- sd(x) skew <- sum((x-m)^3/s^3)/n kurt <- sum((x-m)^4/s^4)/n - 3 return(c(n=n, mean=m, stdev=s, skew=skew, kurtosis=kurt)) }
myvars <- c("mpg", "hp", "wt")
sapply(mtcars[myvars], mystats)
假如要去掉缺失值,函数可写成:
sapply(mtcars[myvars], mystats, na.omit =TRUE)
描述统计也可以这样来计算
library(Hmisc)
myvars <- c("mpg", "hp", "wt")
describe(mtcars[myvars])
统计推断
统计推断是指根据样本数据去推断总体数量特征的方法1。它是在对样本数据进行描述的基础上,对统计总体的未知数量特征做出以概率形式表述的推断1。统计推断是在概率论的基础上依据样本的有关数据和信息,对未知总体的质量特性参数,做出合理的判断和估计2。
统计推断和数据分析是两个不同的概念。数据分析是指对数据进行收集、处理、分析和解释的过程,目的是从数据中提取有用的信息,以便做出决策1。而统计推断是指根据样本数据推断总体数量特征的方法,主要可以分为参数估计问题和假设检验问题2。
简单来说,数据分析是一种方法,而统计推断是一种统计学方法1。
配对设计t检验
要在 R 中执行配对样本 t 检验,可以使用 t.test() 函数12。 该函数将两个数值向量作为输入,并返回一个 t 检验结果对象,其中包含检验统计量、自由度、p 值和置信区间1。
下面是如何使用 t.test() 函数在 R 中执行配对样本 t 检验的示例:
创建两个数值向量
x <- c(1, 2, 3, 4, 5)
y <- c(2, 4, 6, 8, 10)
执行配对样本 t 检验
t.test(x, y, paired = TRUE)
这将输出以下结果:
配对 t 检验
数据:x 和 y
t = -5.7446,df = 4,p 值 = 0.005165
备择假设:均值的真实差值不等于 0
95% 置信区间:
-3.635609 -1.164391
样本估计:
差值的平均值 -2
样本均数和总体均数t检验
总体均数t检验是一种假设检验方法,主要用于样本含量较小(例如n<30),总体标准差σ未知的正态分布。目的是用来比较样本均数所代表的未知总体均数μ和已知总体均数μ01。
在R语言中,样本均数和总体均数t检验可以使用t.test()函数进行1。例如,我们有一个数据集a,我们可以使用以下代码进行样本均数和总体均数t检验:
t.test(a,mu=0)
其中a是数据集的名称,mu是总体均数1。
两(独立)样本t检验
独立样本t检验是一种用于比较两个独立组的平均值是否存在差异的方法1。例如,假设我们测量了100个人的体重:50名女性(A组)和50名男性(B组)。我们想知道女性的平均体重(mA)与男性(mB)是否存在差异。在这种情况下,我们有两组不相交的数据,因此使用独立样本t检验1。
在R语言中,独立样本t检验可以使用t.test()函数进行1。例如,我们有两个数据集a和b,我们可以使用以下代码进行独立样本t检验:
t.test(a,b)
其中a和b是两个数据集的名称。如果我们想要更多的参数控制,可以使用以下代码:
t.test(a,b,var.equal=TRUE,conf.level=0.95)
其中var.equal表示方差是否相等,conf.level表示置信度水平。
R语言组间差异的非参数检验
在R语言中,组间差异的非参数检验可以使用kruskal.test()函数进行1。例如,我们有一个数据集a,我们可以使用以下代码进行组间差异的非参数检验:
kruskal.test(a~b)
其中a是数据集的名称,b是分类变量2。
1: CDA数据分析师官网
2
单因素方差分析
在R语言中,单因素方差分析可以使用aov()函数进行1。例如,我们有一个数据集a,我们可以使用以下代码进行单因素方差分析:
fit <- aov(a~b, data = data)
summary(fit)
其中a是数据集的名称,b是分类变量2。
1: R语言教程
2: 知乎
R语言双因素方差分析方法
在R语言中,双因素方差分析可以使用aov()函数进行1。例如,我们有一个数据集a,我们可以使用以下代码进行双因素方差分析:
fit <- aov(a~b*c, data = data)
summary(fit)
其中a是数据集的名称,b和c是分类变量1。
1: CSDN
R语言重复测量方差分析
在R语言中,重复测量方差分析可以使用ezANOVA包进行1。例如,我们有一个数据集a,我们可以使用以下代码进行重复测量方差分析:
library(ez)
fit <- ezANOVA(data = a, dv = .(b), wid = .©, within = .(d), between = .(e), type = 3)
summary(fit)
其中a是数据集的名称,b是因变量的名称,c是被试编号的名称,d和e是分类变量1。
library(readxl) # 读取数据
data <- read_excel(file.choose())data$Subject <- as.factor(data$Subject)
data$Familiarity <- as.factor(data$Familiarity)
data$Density <- as.factor(data$Density)
attach(data) # 将数据框的变量(列)直接添加到R的搜索路径,调用时就不用加上$
str(data)
head(data)
library(ez) # 加载包
model <- ezANOVA(data, dv = Score, wid = Subject, within = .(Familiarity, Density), type = 3, detailed = T)
model
数据下载地址:
reading.xlsx
提取码:854g
回归分析
R语言回归分析
在R语言中,简单回归分析可以使用lm()函数进行1。例如,我们有一个数据集a,我们可以使用以下代码进行简单回归分析:
fit <- lm(b ~ c, data = a)
summary(fit)
其中a是数据集的名称,b是因变量的名称,c是自变量的名称1
R语言多元回归分析
在R语言中,多元回归分析可以使用lm()函数进行1。例如,我们有一个数据集a,我们可以使用以下代码进行多元回归分析:
fit <- lm(b ~ c + d, data = a)
summary(fit)
其中a是数据集的名称,b是因变量的名称,c和d是自变量的名称1。
R语言logistic回归分析
在R语言中,logistic回归分析可以使用glm()函数进行1。例如,我们有一个数据集a,我们可以使用以下代码进行logistic回归分析:
fit <- glm(b ~ c + d, data = a, family = binomial(link = “logit”))
summary(fit)
其中a是数据集的名称,b是因变量的名称,c和d是自变量的名称1。
R语言主成分和因子分析
R语言主成分和因子分析
主成分分析,PCA的目标是用一组较少的不相关变量代替大量相关变量,同时尽可能保留初始变量的信息,这些推导所得的变量称为主成分,它们是观测变量的线性组合。
$ PC_1 = \alpha_1X_1+\alpha_2X_2+\alpha_3X_3+…+\alpha_nX_n $
探索性因子分析
如果你的目标是寻求可解释观测变量的潜在隐含变量,可使用因子分析。
EFA的目标是通过发掘隐藏在数据下的一组较少的、更为基本的无法观测的变量,来解释一组可观测变量的相关性。这些虚拟的、无法观测的变量称作因子。(每个因子被认为可解释多个观测变量间共有的方差,因此准确来说,它们应该称作公共因子。)
$ X_i = \alpha_1F_1+ \alpha_2F_2+ \alpha_3F_3+…+ \alpha_nF_n $
其中是第i个可观测变量(i = 1…k),是公共因子(j = 1…p),并且p<k。是变量独有的部分(无法被公共因子解释)。可认为是每个因子对复合而成的可观测变量的贡献值。
在R语言中,主成分和因子分析可以使用prcomp()和factanal()函数进行1。例如,我们有一个数据集a,我们可以使用以下代码进行主成分和因子分析:
fit <- prcomp(a)
summary(fit)
fit <- factanal(a, factors = 3)
print(fit, digits = 2, cutoff = 0.6, sort = TRUE)
其中a是数据集的名称。
1: 简书
R语言聚类分析方法
按照一定的相似性度量方式,把接近的一些个体聚在一起。这里主要是相似性度量,不同的数据类型,我们需要用不同的度量方式。除此之外,聚类的思想也很重要,要是按照聚类思想来说,主要有这么几大类,第一大类是基于分割的聚类,比如k-means,以及按照这个思路进行了简单扩展的几个聚类,如k-median等。第二大类呢,就是层次聚类,它其实是把个体之间的关系进行了一个层次展示,具体聚为几类,由人为进行设定。第三大类呢,就是基于密度的聚类,这里不要讲基于密度的聚类和基于概率密度分布的聚类相混淆,这其实是一样的,比如混合模型,就是基于概率分布的聚类,而DBSCAN就是基于密度的聚类,实际上,这里密度是指一指局部密度,而不是概率密度分布。那么第四大类呢,就是基于概率密度分布的聚类,这一类聚类方法主要是假设数据来自某个概率分布,或者是某几个概率分布的组合,进而进行参数估计,确定分布的样子,再反过来看看,样本点属于哪一类。那么第五大类呢,是矩阵的分解(Nonnegative Matrix Factorizations ),这一大类其实和之前的几类明显不同,比如SVD分解,或者其他的分解其实在文本挖掘或者推荐算法里边都属于聚类。最后一大类就是谱聚类了。
在R语言中,聚类分析可以使用kmeans()和hclust()函数进行1。例如,我们有一个数据集a,我们可以使用以下代码进行聚类分析:
fit <- kmeans(a, 3)
print(fit)
fit <- hclust(dist(a))
plot(fit)
其中a是数据集的名称1。
数据分析中缺失值的处理方法
在R语言中,处理缺失值的方法有很多。其中,最简单的方法是删除缺失值所在的行,R语言中提供了两种删除缺失值的函数,分别是complete.cases()函数和na.omit()函数1。此外,还有一些其他的方法,如插值法、回归法、均值法等等2。
例如,我们有一个数据集a,我们可以使用以下代码删除缺失值所在的行:
a <- na.omit(a)
或者使用以下代码删除包含缺失值的列:
a <- a[, colSums(is.na(a)) == 0]
如果你想用均值来填补缺失值,可以使用以下代码:
a[is.na(a)] <- mean(a, na.rm = TRUE)
*** 与chatGPT的会话结束 ***