HBase 0.98开始增加了对cell tags的支持，所以其HFile结构也发生了改变。HFile V3的格式只是在V2格式后增加了标签部分。其他保持不变，所以对V2保持了兼容性。用户可以从V2直接切换到V3。
HFile V3主要的提高是压缩比和，通过把key放在一起 Value放在一起， key存在block 的开始位置，value存在block的结束位置，通过对于key和value应用不同的压缩算法，这样可以获得更好对应key和value的位置信息，可以减少写入磁盘的读写，减少I/O提高速度。
如果从0.98版本之前，先需要升级到0.98后，再更改Ffile V3存储格式。
详细的大家看看jira的信息：
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> HBASE-10451 Enable back Tag compression on HFiles
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