Numba: 使用GPUs加速python

embedded/2024/10/24 2:54:39/

作为python函数的即时编译器,Numba是直接在标准python解释器中运行的,所以我们可以直接在GPU上运行用python写的CUDA kernels(在显卡上运行的函数),换句话说,Numba可以让我们直接使用python而非学习一门新语言的方式方便地编写在GPU上运行的CUDA kernels。

github地址:https://github.com/numba/numba

如何使用 Numba?

使用 Numba 的最常用方法是使用其装饰器集合,以此达到指示 Numba 编译指定函数的效果。当调用 Numba 修饰函数时,函数被编译为机器代码“即时” (JIT,全称是Just-In-Time) 执行,从而使指定代码以本机机器代码速度运行。[4]

使用 condapip 进行安装:

conda install numba 
# or
pip install numba

通过函数装饰器的方式使用 (以下代码示例由 ChatGPT 生成):

python">import numpy as np
from numba import jit# 使用 numba 的 jit 装饰器加速函数
@jit(nopython=True)
def matrix_sum(A):total = 0.0for i in range(A.shape[0]):for j in range(A.shape[1]):total += A[i, j]return total# 创建一个随机的 numpy 数组
A = np.random.rand(1000, 1000)# 调用加速后的函数
result = matrix_sum(A)
print("Sum of matrix elements:", result)"""
在这个示例中:
1. @jit(nopython=True):启用 numba 的 nopython 模式,可以确保整个函数运行时避免解释器的参与,从而加速。
2. matrix_sum 函数中使用双重循环遍历二维 numpy 数组 A,并逐个累加元素。这样可以利用 numba 的 JIT 编译来显著提高运算速度,特别是在处理大规模数据时。
"""

哪些场景下使用 Numba?

(以下内容由ChatGPT基于[5]中润色或根据提问生成)

Numba 支持 Python 的原生函数以及部分 numpy 操作,但对于更高层次的数据处理库(如 pandas),Numba 的加速效果有限,因为它无法直接优化这些库的高度封装操作 [5]。此外,Numba 也不适用于已经经过高度优化的主流机器学习框架(如 scikit-learnTensorFlowPyTorch),这些框架内部已经实现了对计算性能的优化,通常通过 C/C++ 或其他高效计算后端进行加速,因此进一步利用 Numba 进行优化不会带来显著性能提升。

如果代码大量使用 numpy 数组,Numba 可以通过 JIT 编译优化处理,避免纯 Python 循环操作,常见场景有:

  1. 快速矩阵运算
  2. 数据统计分析
  3. 数组元素逐个操作

相关解释

CUDA 的设计思想大致是:向显卡提交一个又一个任务,每一个任务都形如 “给定一个函数,与调用它的参数,请在显卡上运行这个函数”。我们一般称这种“在显卡上运行的函数” 为 CUDA Kernel。[3]

参考资料:

[1] https://developer.nvidia.com/blog/seven-things-numba/

[2] CUDA编程入门

[3] 北大超算队培训资料

[4] Numba 的 ~ 5 分钟指南

[5] Numba简介


http://www.ppmy.cn/embedded/129967.html

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