DICOM图像知识:解析如何在DICOM图像中实现多层覆盖层的显示的方法

devtools/2024/11/24 3:40:38/

目录

1. 覆盖层(Overlay)基础

1.1 覆盖层的定义

DICOM%E4%B8%AD%E7%9A%84%E8%A6%86%E7%9B%96%E5%B1%82%E8%A1%A8%E7%A4%BA-toc" style="margin-left:80px;">1.2 DICOM中的覆盖层表示

2. 解析和处理思路

2.1 提取覆盖层数据

2.2 将覆盖层叠加到图像上

3. 实现示例

4. 注意事项


1. 覆盖层(Overlay)基础

1.1 覆盖层的定义

覆盖层是一种二值掩膜,通常表示为一个与主图像具有相同分辨率的矩阵。覆盖层可以用于:

  • 标记病变位置。
  • 展示分割结果。
  • 添加注释和标注。

DICOM%E4%B8%AD%E7%9A%84%E8%A6%86%E7%9B%96%E5%B1%82%E8%A1%A8%E7%A4%BA">1.2 DICOM中的覆盖层表示

DICOM标准中,覆盖层数据使用专门的DICOM元素表示。主要涉及的DICOM标签包括:

  • Overlay Rows (60xx,0010) 和 Overlay Columns (60xx,0011):定义覆盖层的行数和列数。
  • Overlay Data (60xx,3000):覆盖层的实际二进制数据。
  • Overlay Bit Position (60xx,0102):表示覆盖层数据使用的比特位。

60xx中的xx为覆盖层号,可以从001F,支持多个覆盖层。

2. 解析和处理思路

2.1 提取覆盖层数据

覆盖层数据通常是压缩为位图的二进制数据。解析步骤包括:

  1. 读取DICOM文件:使用DCMTK等库加载DICOM文件。
  2. 获取覆盖层信息:提取Overlay Rows、Overlay Columns、Overlay Data、Overlay Bit Position等信息。
  3. 解码覆盖层数据:将Overlay Data解码为二值矩阵。

2.2 将覆盖层叠加到图像上

叠加覆盖层通常涉及将二值矩阵转换为某种颜色,并将其绘制到原始图像上:

  1. 选择颜色:为每个覆盖层选择不同的颜色(如红色、绿色等)。
  2. 图像叠加:将覆盖层的每个非零像素绘制为选定颜色。
  3. 透明度处理:调整覆盖层的透明度,以便可以同时看到底层图像和覆盖层。

3. 实现示例

下面的C++示例使用DCMTK库读取DICOM文件并将覆盖层叠加到图像上:

#include <dcmtk/dcmdata/dctk.h>
#include <dcmtk/dcmimgle/dcmimage.h>
#include <iostream>
#include <vector>void applyOverlay(DcmDataset* dataset, std::vector<uint8_t>& imageData, int rows, int cols, int overlayGroup) {Uint16* overlayData;long overlayLength;// 获取覆盖层数据dataset->findAndGetUint16Array(DCM_OverlayData | overlayGroup, overlayData, &overlayLength);if (!overlayData) return;Uint16 overlayRows, overlayCols;dataset->findAndGetUint16(DCM_OverlayRows | overlayGroup, overlayRows);dataset->findAndGetUint16(DCM_OverlayColumns | overlayGroup, overlayCols);// 确保覆盖层尺寸与图像一致if (overlayRows != rows || overlayCols != cols) return;int bitPosition;dataset->findAndGetUint16(DCM_OverlayBitPosition | overlayGroup, bitPosition);// 将覆盖层应用到图像for (int i = 0; i < overlayLength; ++i) {for (int bit = 0; bit < 16; ++bit) {if ((overlayData[i] >> bit) & 0x1) {int pixelIndex = (i * 16 + bit);if (pixelIndex < rows * cols) {// 在此示例中,将覆盖层像素设置为红色imageData[pixelIndex * 3] = 255; // RimageData[pixelIndex * 3 + 1] = 0; // GimageData[pixelIndex * 3 + 2] = 0; // B}}}}
}int main() {const char* inputFileName = "input_with_overlay.dcm";DcmFileFormat fileFormat;OFCondition status = fileFormat.loadFile(inputFileName);if (!status.good()) {std::cerr << "Error: cannot read DICOM file (" << status.text() << ")" << std::endl;return 1;}DcmDataset* dataset = fileFormat.getDataset();DiImage* image = new DiImage(dataset, EXS_Unknown);if (image == nullptr || image->getStatus() != EIS_Normal) {std::cerr << "Error: cannot load DICOM image (" << DiImage::getString(image->getStatus()) << ")" << std::endl;delete image;return 1;}int width = image->getWidth();int height = image->getHeight();int numPixels = width * height;// 获取图像数据std::vector<uint8_t> imageData(numPixels * 3);image->getOutputData(imageData.data(), numPixels * 3, 8, 3);// 应用第一个覆盖层applyOverlay(dataset, imageData, height, width, 0x6000);// 可添加更多applyOverlay()调用以处理其他覆盖层// 此处可将imageData保存为图像或进行进一步处理delete image;return 0;
}

4. 注意事项

  • 多层支持DICOM支持多达32层覆盖层。确保在处理时检查所有可能的覆盖层组(0x6000到0x601F)。
  • 颜色和透明度:为每个覆盖层选择合适的颜色和透明度以确保可读性。
  • 数据一致性:确保覆盖层尺寸和图像尺寸匹配。
  • 性能考虑:处理大尺寸的覆盖层数据可能需要优化算法以提高效率。

        通过使用如上方法,可以有效地将多个覆盖层叠加到DICOM图像中,实现丰富的图像标注和信息展示。这在医学影像分析和临床诊断中具有重要的应用价值。


http://www.ppmy.cn/devtools/136443.html

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